Maria Holic cerita dari anime ini berpusat pada seorang gadis bernama Miyamae Kanako . Dia pindah ke sekolah baru yang di khusus kan untuk perumpuan . Dengan niat mengikuti jejak kedua orang tua nya yang saling bertemu di Sekolah Ame no Kisaki . Dia adalah seorang yang energik dan seorang yang memiliki sifat yang aneh .